Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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