Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms