Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms