Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn15Q9Z0S5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms