Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Col4a3Q9QZS0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Col4a3Q9QZS0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms