Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms