Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3b2Q9JME5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms