Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Aldh9a1Q9JLJ2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms