Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Col5a3Q9JLI2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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