Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms