Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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