Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms