Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx12Q9ER00 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms