Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp4Q9DBY0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms