Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf6Q9DBU5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf6Q9DBU5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf6Q9DBU5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf6Q9DBU5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf6Q9DBU5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf6Q9DBU5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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