Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc97Q9DBT3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc97Q9DBT3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc97Q9DBT3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc97Q9DBT3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc97Q9DBT3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc97Q9DBT3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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