Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms