Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms