Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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