Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d4aQ9D7V1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d4aQ9D7V1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d4aQ9D7V1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d4aQ9D7V1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d4aQ9D7V1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms