Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Tmigd1Q9D7L8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Tmigd1Q9D7L8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Tmigd1Q9D7L8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmigd1Q9D7L8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmigd1Q9D7L8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmigd1Q9D7L8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmigd1Q9D7L8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms