Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms