Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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