Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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