Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al3Q9D4U4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms