Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms