Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clvs1Q9D4C9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms