Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms