Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zbed3Q9D0L1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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