Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.92
ChtopQ9CY57 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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