Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Xrcc3Q9CXE6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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