Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms