Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rhobtb3Q9CTN4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rhobtb3Q9CTN4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rhobtb3Q9CTN4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms