Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms