Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms