Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Commd4Q9CQ02 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Commd4Q9CQ02 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Commd4Q9CQ02 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Commd4Q9CQ02 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Commd4Q9CQ02 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Commd4Q9CQ02 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Commd4Q9CQ02 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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