Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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