Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms