Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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