Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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