Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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