Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gnl3l-201ENSMUST00000026297 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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SptssbQ925E8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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SptssbQ925E8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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