Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms