Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snx18Q91ZR2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snx18Q91ZR2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snx18Q91ZR2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Snx18Q91ZR2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snx18Q91ZR2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snx18Q91ZR2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Snx18Q91ZR2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Snx18Q91ZR2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Snx18Q91ZR2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snx18Q91ZR2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Snx18Q91ZR2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Snx18Q91ZR2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Snx18Q91ZR2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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