Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cabp4Q8VHC5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms