Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms