Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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