Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms