Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms