Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms